刘裕，小名寄奴，是魏晋南北朝时，南朝宋的开国皇帝，即赫赫有名的南朝宋武帝。刘裕是汉高祖刘邦的弟弟楚王刘交的第二十一世孙，也算是正宗的汉室宗亲了。
而司马懿的孙子司马炎，篡夺了曹魏的江山，建立了继东汉之后，另一个大一统的王朝西晋。
单从王朝取代上来看，刘裕跟司马懿的后人之间，并没有直接的亡国仇恨。毕竟司马氏篡的是曹魏的江山，而曹氏篡的才是汉室江山。因此，说刘裕是为了复兴汉室江山，替先祖报仇，才将司马懿后代灭族，这个理由太过牵强。
而且，刘裕立国号为“宋”，说明刘裕，只是觉得自己可以做皇帝统治天下，并非是要光复汉室江山。
刘裕本身是一位非常有作为的帝王。他自幼家贫，曾经以卖鞋为生。但是，才能却非常出众。刘裕从军后，先后平定了孙恩叛乱，桓玄篡位，以及卢循、徐道覆发动的兵乱。他还曾两度北伐，消灭了北方的割据政权南燕和后秦。
刘裕在篡夺了东晋的江山之后，积极进行改革，抑制门阀豪强，救济战乱中的百姓；并减少徭役、赋税；禁止官吏们以官府的名义侵占农田、园地。经过一系列的改革，刘裕为刘宋第三任皇帝宋文帝的“永嘉之治”打下了坚实的基础。所以，后世对于刘裕的评价，整体上还是非常高的。
刘裕一生最大的一个污点，就是屠杀了已经禅位的前朝皇帝晋恭帝，以及前朝皇室宗族的众多成员。
当时，非常流行图谶。刘裕篡晋前，流行两句谶语：“晋祚尽昌明，昌明之后有二帝”。昌明就是晋孝武帝司马曜，两句谶语说的是晋朝的国祚到晋孝武帝为止，但是之后还要经历二帝的统治。似乎有点难以理解，看一下史实就明白了。
晋武帝昌明死后，桓玄篡位，晋安帝被贬为平固王。东晋的实际国祚，已经终结了。
刘裕灭了桓玄，重新拥立晋安帝为皇帝。但是刘裕把持了朝政，晋朝的实际统治者已经换人了，此时的东晋只是一个躯壳罢了。谶语的预言一语中的。
刘裕为了尽快实现谶语的后半句，派人杀了晋安帝。晋安帝无后，他就拥立了晋安帝的弟弟晋恭帝。之后，刘裕顺利篡位，取代了东晋的统治，建立了南朝宋，开启了南北朝的时代。
刘裕之所以要杀掉已经退位的晋恭帝，也是由当时复杂的环境所决定的，最主要的是他的儿子尚且年幼。明太祖朱元璋也曾为了巩固建文帝的地位，大肆杀戮将领大臣。
东晋时期形势更加复杂，权臣众多，从立国时的王氏、谢氏家族，到后来篡位的桓氏家族。而刘裕自己也是篡位，才成为了皇帝，这让本就草根的刘裕非常不安，时时刻刻都担心有人借拥立司马氏为由，走他自己拥立晋安帝的旧路，卷土而来。所以，他才要斩草除根。
刘裕的措施就是彻底灭掉晋恭帝的后人，只让晋恭帝养女儿，有了儿子则杀死，并尽量除去其他的司马氏宗亲。最后，晋恭帝不肯自杀，刘裕派人用被褥闷死了晋恭帝。而刘裕也在晋恭帝死后的第二年去世。
刘裕在位期间，还削弱藩镇的力量，增强中央集权，并严控军队。凡是出兵讨伐，都由朝廷调拨，事毕，军队都交还朝廷。可见，刘裕内心是有多么的彷徨不安。
刘裕这点，又和赵宋开国皇帝赵匡胤是何其的相似，只是赵匡胤相对仁厚了一些，毕竟后周郭威和柴荣对赵匡胤有恩。但是，赵宋为了防止兵变再次发生，严控兵权，重文而抑武。
至于司马氏的灭亡，纯粹是司马一族“机关算尽太聪明，反误了卿卿性命”。
司马懿、司马昭、司马炎，都是何等的狡诈阴险。但是西晋武帝之后出了一个“何不食肉糜”的晋惠帝司马衷，闹起了“八王之乱”。司马一族自己人把自己人打成了残废，导致“五胡乱华”，西晋灭亡，“五马南渡”，晋元帝开创了东晋的统治。
而东晋，又是权臣当道，先有王氏，后有谢氏、桓氏，接着又是刘氏，众多皇帝都只是傀儡而已。好不容易出了个稍微有点作为的晋孝武帝，任用谢安，进行改革，迎来了东晋的最后一次复兴，结果却因为逞口舌之快，对自己的张贵人说：“汝以年当废矣。”意思就是，你的年龄大了，到了废弃的时候了。结果当晚就被张贵人一怒之下所杀。司马家的皇帝，真是让人无语至极。
而孝武帝之后的晋安帝，比晋惠帝司马衷还惨，“自少及长，口不能言，虽寒暑之变，无以辩也”。晋安帝不会说话，也不知道春夏秋冬的四季变化。如果不是晋恭帝经常在旁边照顾维护，估计晋安帝早死了。晋恭帝虽然隐忍聪慧，可惜，刘裕势大，他已经无力回天了。因此在禅位时，他很坦然：“晋氏久已失之，今复何恨。”只是他没想到刘裕最后会斩草除根。
司马懿的后人，在东晋末年，多为桓玄、刘裕所杀，能够存活下来的，应该也是非常边缘的旁支小宗了。史书中都不加以记载，说司马懿后人被灭族了，也是有道理的。
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